1938（昭和13）年の県庁舎移転に際して廃棄決定された愛知県庁文書は、徳川黎明会から下附願いがだされ、ほとんどの文書が下附されました。その一部が現在、（財）徳川黎明会徳川林政史研究所、国文学研究資料館に所蔵されています。

また、水産研究・教育機構には、水産関係の愛知県庁文書が所蔵されています。

本館では、これら他機関に所蔵されている資料で、愛知の歴史を知る上で必要な資料について、マイクロ撮影のうえ、複製本を作成して利用に供しています。

徳川林政史研究所所蔵「愛知県庁文書」

主に幕末から明治前期にかけての各分野にわたるもので、愛知県成立期における本県の状況がわかる文書が多くあります。

徳川林政史研究所所蔵「旧名古屋税務監督局所蔵史料」

旧名古屋税務監督局（現在の東海財務局の前身）所蔵史料のうち、愛知県に関係する文書。主に江戸時代後期から明治にかけての土地・租税関係の文書です。

国文学研究資料館所蔵「愛知県庁文書」

主に1880（明治13）年から1907（明治40）年頃の兵事、学事、商工、土木関係の文書が多くあります。また、県庁に引き継がれた郡役所文書もあります。

水産研究・教育機構所蔵「愛知県庁文書」

漁業関係文書や町村条例などがあります。

国立公文書館所蔵資料

内閣文庫には、「府県史料」が所蔵されています。そのうちの愛知県に関係するものは23冊で、複製本で利用できます。

愛知用水史・豊川用水史

「夢の用水」といわれた愛知用水・豊川用水が実現に至るまでの歩みや、通水後の管理と運営、地域開発に関する資料があります。

園芸発達史

昭和56年に刊行された『愛知県園芸発達史』の編さんのために収集された資料です。

議会史

『愛知県議会史』の編さんのために収集された資料です。

刊行物

県で作成した報告書、各種統計書などの行政刊行物や、県内市町村史誌があります。

古文書等

個人等から寄贈や寄託のあった古文書や私文書など、県に関係のある古い資料があります。

その他

官報や愛知県公報（原本又はマイクロフィルム）、新聞類（縮刷版又はマイクロフィルム）があります。また、他の公文書館、個人等から寄贈のあった県に関係のある刊行物等を整理・分類し保存しています。
「太政類典」や「公文録」など明治初期の国の文書についても、国立公文書館所蔵のものをマイクロフィルム化して利用に供しています。
文書類以外にも、昭和10年に県庁舎改築工事が行われた際の工事図面、昭和13年頃の愛知県庁舎等の写真、歴代知事の肖像画や写真などがあります。